Organisation
Stiftelsen BMR:s högsta beslutsfattande organ är styrelsen. Styrelsen består av sju personer och leds av Mia Holmbäck (ordförande sedan januari 2021).
Stiftelsens operativa arbete leds av vd Birgitta Forsström (sedan maj 2021). På kansliet i Helsingfors jobbar ytterligare sex personer: John Juslin, finansdirektör och vice vd, Sonja Ollas-Airinen, specialsakkunnig, Annika Ekblad, specialsakkunnig, Hanna Peltonen, ekonomichef, Erika Grönlund, administrativ koordinator och Lina Laurent, kommunikationsansvarig.
Birgitta Forsström är styrelsemedlem i föreningen Stiftelser och fonder och i Dialogpausstiftelsen.
Organisationsmodell

Sakkunnigutskott
Från och med 2023 har Stiftelsen BMR ett sakkunnigutskott som bereder de ansökningar som lämnas in vid stiftelsens årliga ansökningsprocess varje höst.
Sakkunnigutskottet för utdelning består av tolv personer med expertis inom områden som berör barn och unga: socialvetenskaper, pedagogik, forskning och högre utbildning. De sakkunniga väljs för ett år i taget och kan väljas för högst tre år.
Sedan tidigare har Stiftelsen BMR ett finansutskott som består av fyra utomstående sakkunninga. Finansutskottet är ett rådgivande organ för vd:n och finansdirektören. Medlemmarna i finansutskottet kan väljas för högst fem år.